Евгений Александрович Прошкин родился в Москве. Учился в Московской Геологоразведочной академии, в Литературный институт имени А. М. Горького, из которого ушел после третьего курса. 

Служил в Советской Армии в частях береговой охраны на Курильских островах. После армии работал в страховой компании, на студии кабельного телевидения, в банке, на колбасном заводе. 

В 1991 г. в журнале «Четвёртое измерение» опубликовали дебютный рассказ Е. Прошкина «Запасной вариант». Первая книга писателя — роман «Война мёртвых» (2000). Затем вышли романы — «Слой» (2001), «Механика вечности» (2001), «Зима 0001» (2002), «Слой Ноль» (2003), «Магистраль» (2003). В соавторстве с Вячеславом Шалыгиным в 2002 г. был издан фантастико-юмористический роман «Наши фиолетовые братья». 

За роман «Истребитель "Родина»» (2005) Евгению Прошкину была вручена премия «Лунная Радуга». 

Затем последовали произведения «Смертники» (совместно с Олегом Овчинниковым) (2010), «Враг «Монолита» (совместно с Олегом Овчинниковым) (2011), «Палачи» (совместно с Олегом Овчинниковым) (2011), «Контур боли» (совместно с Олегом Овчинниковым) (2013), «В режиме бога» (Драйвер Заката) (2016).